Muitas técnicas diferentes podem ser usadas para coletar amostras de DNA de um cão, e cada opção tem variações em qualidade e significância. Uma amostra de sangue é frequentemente usada como padrão ouro para DNA de alta qualidade, mas requer um veterinário para ser coletada. Glóbulos brancos doentes também podem adquirir mutações durante a vida do cão, conhecidas como mutações somáticas. O DNA coletado de swabs de bochecha é usado rotineiramente e é fácil para os donos coletarem. No entanto, esse DNA pode ser contaminado com DNA de bactérias ou até mesmo de outros cães ao amamentar ou lamber outros animais. A qualidade tende a ser inferior e mais variável do que o DNA do sangue. Outras amostras também podem ser usadas para coletar DNA, como urina, biópsias ou tecidos coletados durante a autópsia.
Perfil de DNA – Parentesco – O principal uso do perfil de DNA canino é validar a ascendência. Os painéis de ascendência baseiam-se em conjuntos de marcadores padronizados usados para estabelecer identidades caninas únicas. Os marcadores variam de acordo com o painel e não são intercambiáveis. O programa de ascendência do AKC já perfilou mais de um milhão de cães para fornecer resultados confiáveis de ascendência. Este serviço é importante para validar registros de criadores e sua importância aumenta à medida que os testes de DNA se expandem. Os resultados dos testes de saúde genética podem ser vinculados aos resultados de ascendência para garantir a precisão dos resultados dos testes.